MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Achromobacter xylosoxidans NH44784-1996 complete genome

Total Repeats: 18576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_021285	CAGA	2	8	6887230	6887237	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18502	NC_021285	GCCC	2	8	6887239	6887246	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18503	NC_021285	ACT	2	6	6887417	6887422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18504	NC_021285	GGCA	2	8	6887470	6887477	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18505	NC_021285	CGA	2	6	6887571	6887576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18506	NC_021285	CGG	2	6	6887597	6887602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18507	NC_021285	C	6	6	6887617	6887622	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18508	NC_021285	C	6	6	6887895	6887900	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18509	NC_021285	A	6	6	6888118	6888123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18510	NC_021285	TTTG	2	8	6888145	6888152	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18511	NC_021285	TGG	2	6	6888173	6888178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18512	NC_021285	TTC	2	6	6893960	6893965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18513	NC_021285	GC	3	6	6893976	6893981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18514	NC_021285	GCG	3	9	6894928	6894936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18515	NC_021285	CCT	2	6	6895493	6895498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18516	NC_021285	CGC	2	6	6896636	6896641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18517	NC_021285	CTT	2	6	6896645	6896650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18518	NC_021285	GC	3	6	6896692	6896697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18519	NC_021285	GGC	2	6	6896712	6896717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18520	NC_021285	GCC	2	6	6896723	6896728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18521	NC_021285	CG	3	6	6896744	6896749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18522	NC_021285	GC	3	6	6896829	6896834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18523	NC_021285	A	6	6	6896842	6896847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18524	NC_021285	ACA	2	6	6896910	6896915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18525	NC_021285	ATC	2	6	6896968	6896973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18526	NC_021285	GC	5	10	6897003	6897012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18527	NC_021285	CTTT	2	8	6897559	6897566	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18528	NC_021285	T	7	7	6897564	6897570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18529	NC_021285	GC	4	8	6897571	6897578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18530	NC_021285	CG	3	6	6897594	6897599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18531	NC_021285	GCT	2	6	6897621	6897626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18532	NC_021285	TA	3	6	6897654	6897659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18533	NC_021285	GGC	2	6	6903929	6903934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18534	NC_021285	GCC	3	9	6903939	6903947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18535	NC_021285	TCC	2	6	6903951	6903956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18536	NC_021285	CCGG	2	8	6903963	6903970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18537	NC_021285	GCG	2	6	6903988	6903993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18538	NC_021285	CGC	2	6	6903998	6904003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18539	NC_021285	ATGA	2	8	6904016	6904023	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18540	NC_021285	TTC	2	6	6905306	6905311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18541	NC_021285	CCG	2	6	6907094	6907099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18542	NC_021285	CTC	2	6	6908511	6908516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18543	NC_021285	GCC	2	6	6908547	6908552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18544	NC_021285	GC	3	6	6908597	6908602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18545	NC_021285	GGC	2	6	6909489	6909494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18546	NC_021285	CGG	2	6	6909508	6909513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18547	NC_021285	T	7	7	6909573	6909579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18548	NC_021285	CGG	3	9	6911045	6911053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18549	NC_021285	GGC	2	6	6911064	6911069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18550	NC_021285	GCCGC	2	10	6911073	6911082	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18551	NC_021285	GC	3	6	6911106	6911111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18552	NC_021285	GCC	2	6	6911801	6911806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18553	NC_021285	CCG	2	6	6911825	6911830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18554	NC_021285	CCTT	2	8	6911873	6911880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18555	NC_021285	CCGGC	2	10	6912848	6912857	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18556	NC_021285	GCCA	2	8	6912861	6912868	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18557	NC_021285	CGC	2	6	6912875	6912880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18558	NC_021285	ACGCC	2	10	6912904	6912913	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
18559	NC_021285	CTG	2	6	6913279	6913284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18560	NC_021285	CGTT	2	8	6914567	6914574	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18561	NC_021285	TAT	2	6	6914621	6914626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18562	NC_021285	CGGG	2	8	6915412	6915419	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18563	NC_021285	TCCGG	2	10	6915437	6915446	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18564	NC_021285	CGGC	2	8	6915452	6915459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18565	NC_021285	CGC	3	9	6915464	6915472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18566	NC_021285	ACG	2	6	6915488	6915493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18567	NC_021285	CCTG	2	8	6916323	6916330	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18568	NC_021285	CCCG	2	8	6916334	6916341	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18569	NC_021285	GTA	2	6	6916354	6916359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18570	NC_021285	A	7	7	6916381	6916387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18571	NC_021285	TCT	2	6	6916415	6916420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18572	NC_021285	CGTC	2	8	6916456	6916463	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18573	NC_021285	ATC	2	6	6916468	6916473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18574	NC_021285	ACC	2	6	6916520	6916525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18575	NC_021285	CGA	2	6	6916615	6916620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18576	NC_021285	GC	4	8	6916645	6916652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.